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Des livres sur la génétique des populations ou évolutive ?

Des livres sur la génétique des populations ou évolutive ?


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J'ai récemment été impliqué dans des collaborations qui me demandent de modéliser la génétique des populations eucaryotes. J'ai peur de "réinventer la roue" ou de faire des erreurs conceptuelles (par exemple en simplifiant des hypothèses) dans de nombreuses techniques et décisions prises jusqu'à présent.


J'apprécierais beaucoup les recommandations de livres sur la génétique des populations/évolution ou la micro évolution pour faire face à ces peurs. Les critères préférables sont :

  1. Présente de manière intuitive les concepts clés.

  2. Accent sur la modélisation avec des exemples de problèmes et leurs solutions.

  3. Relativement court (je prévois de lire d'un bout à l'autre).


TL;DR

Je recommanderais Population Genetics: A Concise Guide (Gillespie) pour une introduction à la génétique des populations / évolutive (merci AGS d'avoir souligné cette grosse erreur dans la première version de ma réponse).

Je recommanderais un guide du biologiste sur la modélisation mathématique en évolution et en écologie (Otto et Day) si vous souhaitez assurer vos connaissances en mathématiques en apprenant leur application à la biologie évolutive.

Livres d'entrée généraux sur la génétique des populations

Il existe plusieurs livres qui offrent une introduction à la génétique des populations. J'ai lu Principes de génétique des populations (Hartl & Clarke). Je l'ai apprécié mais si j'étais vous, je pense que je préférerais essayer Elements of Population Genetics (Charlesworth) ou Population Genetics (Hamilton). Il y a aussi la Génétique des Populations (Hedrick). J'aurais tendance à penser que ce dernier livre présente de nombreuses données empiriques sur la génétique des populations et ne se concentre pas autant que les autres sur les concepts théoriques (mais je peux me tromper). Le livre de Gillespie Population Genetics: A Concise Guide est un classique. C'est court, très facile à suivre et agréable à lire. Le livre de Gillespie est peut-être un peu dépassé mais je le recommande tout de même fortement.

Accent sur la modélisation analytique

Un guide du biologiste sur la modélisation mathématique en évolution et en écologie (Otto et Day) est un très bon livre et très accessible. Il fait une bonne critique de toutes les matières qui sont habituellement enseignées aux étudiants de première année en biologie comme l'algèbre linéaire par exemple. Il est très accessible et en attendant il va assez loin puisqu'il finit par parler de l'application de l'équation de diffusion en génétique des populations (travaux de Kimura entre autres). Ce livre présente quelques modèles importants en génétique des populations, mais comme il vise à fournir les outils de modélisation mathématique en écologie et en évolution, il peut sous-estimer certains domaines de l'écologie et de la biologie évolutive. Par exemple, le livre ne parle pas de la structure de la population ni de la théorie des jeux évolutionnaires et il y a peu de choses sur la théorie de la coalescence.

Autres livres traitant de sujets spécifiques au sein de la génétique des populations

Coalescent Theory: an Introduction (John Wakeley) est un bon livre. Je ne l'ai pas lu complètement pour des questions de temps et parce que les calculs sont un peu compliqués pour moi. La théorie de la coalescence offre un ensemble très important d'outils mathématiques en biologie évolutive.

Il y a aussi la génétique mathématique des populations (Ewens). Je suis en train de le lire. Ce n'est certainement pas un livre d'introduction et il ne couvre vraiment pas beaucoup des domaines les plus courants de la génétique des populations.

Si vous êtes particulièrement intéressé par la population structurée par âge, Evolution des populations structurées par âge (Charlesworth) est un très bon livre.

La modélisation de l'évolution (Roff) propose une discussion sur la façon de définir mathématiquement la fitness à partir des traits phénotypiques. Bien qu'il soit intéressant, je ne vous conseillerais pas de l'acheter. De plus, toutes les mathématiques sont assez basiques et il vise à expliquer comment effectuer une modélisation mathématique avec R qui n'est à mon avis pas indispensable à apprendre car d'autres langages font un meilleur travail pour traiter les mathématiques (Mathematica par exemple).

Evolutionary Conservation Biology (Ferrière, Couvet et Dieckmann) est un très bon livre de conservation et de génétique de la conservation. Il développe des modèles mathématiques qui présentent un intérêt particulier pour la conservation des populations et des communautés.

Ecology, Genetics and Evolution in Metapopulations (Hanski et Gaggiotti) est un livre qui pourrait aussi vous intéresser. Cependant, il se concentre beaucoup plus sur l'écologie que les autres que j'ai cités ci-dessus. Remarque : je ne l'ai pas lu entièrement.

Si vous êtes intéressé par la sélection des parents et le niveau de sélection, vous voudrez peut-être jeter un œil à Major Transitions In Evolution (Maynard Smith et Szathmary) qui est un classique (je ne l'ai pas lu cependant) ou The Major Transitions in Evolution Revisited ( Calcott et Sterelny) qui englobent l'opinion de nombreux auteurs sur le sujet. Dynamique évolutive : explorer les équations de la vie (Nowak) présente également un intérêt particulier. pour ceux qui s'intéressent à l'épidémiologie. Enfin, vous voudrez peut-être jeter un œil aux livres extrêmement bien écrits et faciles à lire de Dawkins tels que Le phénotype étendu (Dawkins) par exemple. Le livre Dawkins est très populaire et très très introductif. Il offre plus une façon de penser que la science réelle derrière la biologie évolutive.


La liste de @Remi.b est excellente, mais elle devrait également inclure Population Genetics: A Concise Guide de Gillespie.


Pas relativement court, mais je vais répéter une recommandation que je viens de faire dans un autre fil. La génétique des populations et la théorie de la micro-évolution d'Alan Templeton couvrent bon nombre des sujets énumérés ci-dessus et reposent sur l'auto-apprentissage de diverses statistiques sur la structure de la population, avec des exemples. Il s'agit d'un manuel d'introduction destiné aux personnes ayant des connaissances statistiques (bien qu'il comprenne également une annexe statistique). Il y a aussi beaucoup de discussions sur l'inférence bayésienne et d'autres méthodes de modélisation.


Personnellement, j'aime le Primer on Population Biology de Wilson et Bossert. Pour un livre qui a presque 45 ans, ça tient plutôt bien. L'une des meilleures choses à propos de ce livre est qu'il fournit des exemples, puis décrit les solutions étape par étape. De temps en temps, cela devient un peu trop mathématique pour cette Biologiste, mais dans l'ensemble, je le trouve lisible et instructif.

Je pense que ce livre correspond de très près à tous vos critères.


Génétique des populations et évolution

Au moins depuis les années 1940, le néodarwinisme a prévalu en tant que point de vue consensuel dans l'étude de l'évolution. Le mécanisme de l'évolution dans cette perspective est la sélection naturelle conduisant à l'adaptation, travaillant sur un substrat de mutations adaptatives aléatoires. Comme l'étude de la variation génétique dans les populations naturelles et l'étude des équations mathématiques de sélection relèvent d'un domaine appelé génétique des populations, la génétique des populations est devenue le noyau de la théorie de l'évolution. À tel point que le fait qu'il y ait plus dans la théorie de l'évolution que la génétique des populations est devenu quelque peu obscur. La génétique du processus évolutif, ou la génétique du changement évolutif, était presque toute la biologie évolutive. Au cours des 10 dernières années, cette position dominante de la génétique des populations au sein de la biologie évolutive a été remise en question. En écologie évolutive, la théorie de l'optimisation s'est avérée plus utile que la génétique des populations pour des prédictions intéressantes, en particulier des stratégies d'histoire de vie. A partir du développement de la biologie mentale, les contraintes du développement et le rôle de la régulation interne ont été soulignés. À partir de la paléobiologie, une proposition a été avancée pour décrire les archives fossiles et le processus évolutif comme une série d'équilibres ponctués exhortant ainsi les généticiens des populations à donner un compte rendu plausible de la façon dont cela pourrait se produire. Tous ces développements tendent à occulter le rôle central de la génétique des populations dans la biologie évolutive.


Gènes dans les populations

Darwin savait que des variations héréditaires sont nécessaires pour que l'évolution se produise. Cependant, il ne savait rien des lois de Mendel sur la génétique. Les lois de Mendel ont été redécouvertes au début des années 1900. Ce n'est qu'alors que les scientifiques pourraient comprendre pleinement le processus d'évolution. Nous savons maintenant que les variations de traits sont héréditaires. Ces variations sont déterminées par différentes allèles. Nous savons également que l'évolution est due à un changement d'allèles au fil du temps. Combien de temps ? Cela dépend de l'échelle d'évolution.

  • Microévolution se produit sur une période de temps relativement courte au sein d'une population ou d'une espèce. Les Grant ont observé ce niveau d'évolution chez les pinsons de Darwin (voir le concept "Biogéographie").
  • Macroévolution se produit au cours du temps géologique au-dessus du niveau de l'espèce. Les archives fossiles reflètent ce niveau d'évolution. Il résulte d'une microévolution qui s'est déroulée sur plusieurs générations.

Rappelez-vous que les individus n'évoluent pas. Leur gènes ne change pas avec le temps. L'unité d'évolution est la population. UNE population se compose d'organismes de la même espèce qui vivent dans la même zone. En termes d'évolution, la population est supposée être un groupe relativement fermé. Cela signifie que la plupart des accouplements ont lieu au sein de la population. La science qui se concentre sur l'évolution au sein des populations est génétique des populations. C'est une combinaison de la théorie de l'évolution et de la génétique mendélienne.

Pool de gènes

La constitution génétique d'un individu est l'individu&rsquos génotype. Une population est constituée de plusieurs génotypes. Ensemble, ils constituent le pool génétique de la population. Les gène bassinse compose de tous les gènes de tous les membres de la population. Pour chaque gène, le pool génétique comprend tous les différents allèles du gène qui existent dans la population. Pour un gène donné, la population est caractérisée par la fréquence des différents allèles du pool génétique.

Fréquences alléliques

Fréquence allélique est la fréquence à laquelle un allèle apparaît dans un pool génétique par rapport aux autres allèles de ce gène. Regardez l'exemple dans le Table au dessous de. La population dans le tableau compte 100 membres. Dans une espèce à reproduction sexuée, chaque membre de la population possède deux copies de chaque gène. Par conséquent, le nombre total de copies de chaque gène dans le pool génétique est de 200. Le gène de l'exemple existe dans le pool génétique sous deux formes, les allèles UNE et une. Connaissant les génotypes de chaque membre de la population, nous pouvons compter le nombre d'allèles de chaque type dans le pool génétique. Le tableau montre comment cela est fait.

Génotype Nombre d'individus dans la population avec ce génotype Nombre d'allèles UNEContribué au pool de gènes par ce génotype Nombre d'allèles uneContribué au pool de gènes par ce génotype
AA 50 50 &fois 2 = 100 50 &fois 0 = 0
Aa 40 40 &fois 1 = 40 40 &fois 1 = 40
aa 10 10 &fois 0 = 0 10 &fois 2 = 20
Totaux 100 140 60

Que la lettre p représente la fréquence de l'allèle UNE. Que la lettre q représente la fréquence de l'allèle une. On peut calculer p et q comme suit:

  • p = nombre de UNE allèles/nombre total d'allèles = 140/200 = 0,7
  • q = nombre de une allèles/nombre total d'allèles = 60/200 = 0,3
  • Remarquerez que p + q = 1.

L'évolution se produit dans une population lorsque les fréquences alléliques changent au fil du temps. Qu'est-ce qui fait changer les fréquences alléliques ? Cette question a été répondue par Godfrey Hardy et Wilhelm Weinberg en 1908 (voir le Théorème de Hardy-Weinberg concept).


4 - Génétique des populations

William Henry Lang (1923) et Irma Andersson (plus tard Andersson-Kottö, par exemple Andersson, 1923, 1927 Andersson-Kottö, 1929, 1930, 1931) ont été des pionniers dans le domaine de la génétique des fougères. Lang (1923) a été le premier à démontrer l'hérédité mendélienne simple chez une fougère avec son étude expérimentale de l'hérédité des bords des feuilles entières par rapport aux bords incisés chez Scolopendrium vulgare. Andersson a étudié l'hérédité chez les fougères et a été le premier à introduire l'utilisation d'un milieu de croissance à base d'agar pour l'étude expérimentale des gamétophytes des fougères (Andersson, 1923). Ces pionniers ont ouvert la voie à de futures explorations de la génétique des populations de fougères et de lycophytes.

En considérant comment les fougères et les lycophytes développent et maintiennent la variation génétique, les chercheurs contemporains ont utilisé un éventail de techniques pour explorer plusieurs sujets primaires et entrelacés tels que les implications génétiques des populations de la biologie de la reproduction (y compris la charge génétique), la diversité génétique et la structure des populations, les gènes flux et divergence, et la génétique de la dispersion et de la colonisation. L'objectif de ce chapitre est de passer en revue la littérature sur la génétique des populations de fougères et de lycophytes dans ces grandes catégories, de fournir une synthèse des connaissances actuelles et de suggérer de futures directions d'étude possibles. Nous nous concentrerons principalement sur les taxons homosporés car peu de recherches en génétique des populations ont été menées sur les taxons hétérosporés.

Génétique des populations et biologie de la reproduction

Une compréhension de la biologie de la reproduction des individus et des populations est fondamentale pour discuter de la génétique des populations.


Génétique et logique de l'évolution

"pour tous ceux qui souhaitent en savoir plus sur les gènes et l'évolution et aller au-delà de la théorie classique en classe - ce livre est fait pour vous. [will] vous emmènera dans un voyage que vous ne regretterez pas." (Hérédité, février 2005)

"Pour tous ceux qui souhaitent en savoir plus sur les gènes et l'évolution et aller au-delà de la théorie classique en classe - ceci est pour vous. " (Hérédité, Vol. 94, 2005)

"Ce livre est bien écrit et serait probablement principalement d'intérêt pour les étudiants en évolution qui ont une perspective plus philosophique ou pour les étudiants en philosophie intéressés par l'évolution." (American Journal of Human Genetics, septembre 2004)

"Ce livre est parfaitement adapté aux étudiants et aux scientifiques de divers domaines qui souhaitent comprendre le fonctionnement de l'évolution grâce à la génétique." (E-STREAMS, août 2004)

"Ce livre représente un effort courageux pour élargir la pensée évolutionniste dans de nombreuses spécialités biologiques." (Choice, juin 2004, Vol. 41 No. 10)

Biographies de l'auteur

Kenneth M Weiss est professeur Evan Pugh d'anthropologie et de génétique à la Penn State University. Après s'être spécialisé en mathématiques à l'Oberlin College, il a suivi une formation supérieure en anthropologie biologique et en génétique à l'Université du Michigan, où il a obtenu son doctorat en 1972. Il a beaucoup écrit sur les principes et la biologie de l'évolution, la génétique humaine et les complexités des relations entre les gènes et des traits comme la maladie humaine ou les modèles de développement. Il écrit une chronique régulière sur les problèmes et les enjeux de l'évolution et de la génétique pour le journal Anthropologie évolutive, et est l'auteur de Variation génétique et maladie humaine : principes et approches évolutives. Il a également été météorologue professionnel.

Anne Buchanan est chercheur scientifique principal au département d'anthropologie de la Penn State University. Elle est titulaire d'un baccalauréat en anthropologie de l'Université du Massachusetts et d'un doctorat en études démographiques de l'École de santé publique de l'Université du Texas. Elle a travaillé sur des problèmes à l'échelle de la population liés à la santé et à la génétique, ainsi qu'à la génétique moléculaire et du développement, et a publié dans divers domaines, notamment l'anthropologie, la démographie, l'épidémiologie, l'épidémiologie génétique et la génétique du développement.


Les généticiens dénoncent un livre sur la race et l'évolution

Un best-seller par l'ancien New York Times L'écrivain scientifique Nicholas Wade sur l'évolution humaine récente et ses effets potentiels sur les cultures humaines a attiré des critiques depuis sa publication de printemps. Aujourd'hui, près de 140 généticiens chevronnés des populations humaines à travers le monde, dont beaucoup de travaux ont été cités dans le livre, ont signé une lettre à La critique du livre du New York Times déclarant que Wade a mal interprété leur travail. La lettre critique « le détournement par Wade de la recherche de notre domaine pour soutenir les arguments sur les différences entre les sociétés humaines » et devrait paraître dans le numéro du 10 août de la Critique de livre. Il est disponible en ligne dès aujourd'hui.

Le livre, Un héritage gênant : gènes, race et histoire humaine, soutient que les races humaines sont une réalité biologique et que l'évolution humaine récente a conduit à des différences raciales dans le comportement économique et social. Dans le livre, Wade suggère que de telles différences génétiques peuvent aider à expliquer pourquoi certaines personnes vivent dans des sociétés tribales et d'autres dans des civilisations avancées, pourquoi les Afro-Américains sont prétendument plus violents que les Blancs et pourquoi les Chinois peuvent être bons en affaires.

Le livre a reçu des critiques fulgurantes de la part de scientifiques et d'écrivains scientifiques, dont une de David Dobbs dans La critique du livre du New York Times, et certains scientifiques ont également pesé sur les blogs. Maintenant, les généticiens ont élaboré une réponse commune, concluant qu'« il n'y a aucun soutien du domaine de la génétique des populations pour les conjectures de Wade ». La liste des signataires se lit comme un who's who des chercheurs dans le domaine et comprend des généticiens bien connus comme Evan Eichler de l'Université de Washington, Seattle David Goldstein de l'Université Duke et Michael Hammer de l'Université de l'Arizona.

La lettre était dirigée par cinq généticiens des populations qui avaient discuté de manière informelle du livre lors de conférences, explique le co-organisateur Rasmus Nielsen de l'Université de Californie à Berkeley. « Il y avait le sentiment que nos recherches avaient été détournées par Wade pour promouvoir son programme idéologique », dit Nielsen. « L’indignation… était palpable. » Molly Przeworski de l'Université de Columbia, un autre organisateur, a déclaré que le groupe "a essayé de contacter des généticiens des populations dont les travaux avaient été cités par Wade". Ils n'ont eu aucun mal à obtenir des signatures, en accumulant 100 au cours de la première semaine, dit-elle.

Les organisateurs de la correspondance et les éditeurs de la Critique de livre a maintenu la lettre sous embargo jusqu'à sa publication aujourd'hui et a refusé de la mettre à la disposition de Wade pour une réponse immédiate. Mais lors de précédentes ripostes aux critiques du livre, notamment dans un article du 19 juin Huffington Post article intitulé "Cinq critiques disent que vous ne devriez pas lire ce livre 'dangereux'", Wade a accusé ses critiques d'être "endoctrinés dans le credo des sciences sociales qui interdit tout rôle pour l'évolution dans les affaires humaines" et a soutenu que l'argument central du livre " n'a été contestée par aucun scientifique sérieux.

Les organisateurs de la lettre disent qu'ils espèrent démontrer que le contraire est vrai. Par exemple, Sarah Tishkoff de l'Université de Pennsylvanie dit qu'elle a signé la lettre parce que « [m]y mes propres recherches ont été utilisées comme preuve scientifique de concepts tels qu'il y a entre trois et cinq races ». Tishkoff dit que son travail sur la génétique de diverses populations africaines ne soutient pas cette affirmation. David Reich, de l'Université de Harvard, ajoute : "Nos résultats ne fournissent même pas un soupçon de soutien en faveur des conjectures de Wade."

*Mise à jour, 9 août, 6h05 :Nicholas Wade a publié une déclaration en réponse à la lettre. Il écrit:

Cette lettre est motivée par la politique, pas la science. Je suis convaincu que la plupart des signataires n'ont pas lu mon livre et répondent à un résumé biaisé conçu par les organisateurs.

Comme aucun lecteur de la lettre ne pourrait le deviner, "A Troublesome Inheritance" soutient que l'opposition au racisme devrait être fondée sur des principes, et non sur le mythe anti-évolutionnaire selon lequel il n'y a pas de base biologique à la race.

Malheureusement, de nombreux spécialistes des sciences sociales ont longtemps nié qu'il existe une base biologique à la race. Ce credo, prédominant dans le monde académique, entrave de plus en plus la recherche. Les biologistes risquent de nuire à leur carrière s'ils écrivent explicitement sur la race. Inutile de dire que cela rend difficile l'exploration des différentes voies évolutives que les populations humaines ont empruntées à travers l'histoire depuis la dispersion de la patrie africaine il y a 50 000 ans.

« A Troublesome Inheritance » cherche à expliquer comment la race peut être comprise sans racisme. … J'espère que les lecteurs verront à travers le manque de détails dans leurs accusations et jugeront mon livre par eux-mêmes.

Je pourrais peut-être signaler une erreur dans l'une des rares déclarations spécifiques de leur lettre. Ils m'accusent de dire que «la récente sélection naturelle a conduit à des différences mondiales dans le QI. résultats de test." Je ne dis rien de tel. Ce que je dis (p. 193), c'est qu'« il peut être dangereux de comparer les scores de QI de différentes races si l'on ne tient pas compte des différences de richesse, de nutrition et d'autres facteurs qui influencent le QI. …

J'exhorte tous les généticiens qui ont signé la lettre, dont plusieurs que je compte comme amis, à lire maintenant mon livre et à juger dans quelle mesure, le cas échéant, leur condamnation était justifiée.


Ouvrages de référence de génétique téléchargement gratuit Biologywala 3:

Télécharger Principe et analyse génétique

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4) Génétique : Par B.D. Singh

Ce sont les livres de référence supplémentaires de la génétique que le téléchargement gratuit n'est pas disponible sur Biologywala. Mais c'est un excellent livre de génétique écrit dans un langage facile. Le livre a été conçu et arrangé dans un ordre plus logique maintenant.

Le n'a pas trop d'informations sur vous, le point important a été donné dans un langage simple et clair. Chaque chapitre contient des informations à jour, tout comme la compréhension moderne de la génétique.

Si vous voulez en savoir plus sur les PRINCIPES IMPORTANTS DE LA TECHNIQUE DE CULTURE DE TISSUS VÉGÉTAUX, visitez le site Web :

Merci d'avoir visité Biologiewala. J'espère que vous aimerez nos nouveaux livres de référence de blog sur la génétique à télécharger gratuitement. Si vous ne parvenez pas à télécharger des livres, envoyez-nous un DM sur Instagram, nous vous enverrons de toute façon, c'est une promesse. Si vous pensez que cet article vous a aidé ou si vous avez des suggestions ou des exigences, alors commentez ci-dessous. Préparez-vous intelligemment et durement pour l'examen, rendez votre famille et vous-même fiers. Rendez-vous dans le prochain article.


Pourquoi étudier la génétique des populations et évolutive ?

Il est important de comprendre le fonctionnement de la génétique des populations et de la génétique évolutive afin de pouvoir maintenir la diversité génétique. Plus nous avons d'allèles dans une population pour chaque espèce, plus il est probable qu'elle persiste dans le paysage.

C'est comme avoir tout un sac d'outils à votre disposition. Si une maladie inattendue ou un autre défi survient, les populations avec une diversité génétique élevée (c'est-à-dire un nombre élevé d'allèles différents) sont plus susceptibles de persister car il est probable qu'un individu au sein de la population aura les allèles nécessaires pour survivre, comme le résistant Diables de Tasmanie. Ils ont le bon outil pour le travail, tout comme un bon couteau suisse.

Il est possible que l'allèle résistant n'ait été présent que dans une poignée de démons pour commencer si ceux-ci avaient été anéantis par hasard, alors l'espèce entière aurait été condamnée parce que ce trésor salvateur aurait été perdu.

En étudiant les allèles au sein des populations, les scientifiques peuvent travailler pour s'assurer que les écosystèmes fonctionnent naturellement et efficacement, quels que soient les défis auxquels ils sont confrontés.


Génétique évolutive

Motivés par le désir de comprendre les bases mécanistiques du changement évolutif, une grande partie de notre travail implique l'analyse génétique de types de mutants issus de diverses expériences de sélection. Mais parfois, nous faisons de la génétique parce que c'est tout simplement amusant. Et une fois que l'on a le bogue, il est difficile de résister à la tentation de résoudre les énigmes "ce qui l'a causé" de la même manière qu'un détective résout les crimes "qui l'a commis".

Génétique de spécialisation de niche

Nos premières incursions dans la génétique évolutive ont été motivées par les mutants spécialisés de niche apparus au cours de la Pseudomonas radiation adaptative. Le travail a été commencé par Sophie Kahn, l'un des premiers D. Phil de Rainey. étudiants à Oxford (voir Spiers et al 2002). Elle a fait un merveilleux travail de pionnière, à l'époque où nous avions une séquence du génome et où l'identification de l'emplacement génomique des transposons nécessitait un transfert de Southern, des bibliothèques génomiques et le clonage de morceaux d'ADN incroyablement gros à l'aide d'enzymes de restriction dont les positions de clivage les uns par rapport aux autres étaient inconnus. Les choses ont avancé : nous avons maintenant séquencé le génome de l'ancêtre (Silby et al 2009) et armé de cette référence il devient possible de profiter des technologies de reséquençage du génome, RNA-seq et Tn-seq à merveille.

Au fil des ans, tout en continuant d'étudier la génétique des mutants spécialisés de niche (par exemple, Spiers et al 2002, Knight et al 2006, Bantinaki et al 2007, Ferguson et al 2009, McDonald et al 2009, Farr et al 2017), avec un de nombreux travaux importants sur la cellulose d'Andrew Spiers, nous avons également approfondi les bases mécanistiques des génotypes à commutation stochastique qui sont nés à la fois de l'expérience d'évolution inverse de Bertus Beaumont et des travaux sur l'évolution de la multicellularité de Katrin Hammerschmidt et Caroline Rose — même le switch génétique du phage lambda avec Dominik Refardt.

Carte génotype à phénotype / règles d'évolution adaptative

Plus récemment, et résultant d'une étude détaillée de la génétique des mutants à propagation des rides, est venue l'appréciation de l'importance de la carte génotype à phénotype et du rôle qu'elle joue en affectant la probabilité que les phénotypes mutants soient réalisés. Les travaux de Mike McDonald (McDonald et al 2009) ont montré que la fonction des composants régulateurs et leurs inter-connectivités contribuent à l'évolution moléculaire parallèle. Compte tenu de cela, il semblait raisonnable d'envisager la possibilité qu'une meilleure compréhension de la carte génotype à phénotype puisse fournir un aperçu des règles par lesquelles de nouveaux phénotypes adaptatifs apparaissent (Lind et al 2015). Cela s'est avéré vrai comme l'ont démontré avec élégance Peter Lind et Eric Libby qui y sont parvenus via une combinaison d'expérience et de modélisation mathématique (Lind et al 2019).

À l'heure actuelle, Dave Rogers, Michael Barnett et Joanna Summers continuent le cœur de notre génétique évolutive en mettant l'accent sur la carte phénotype à génotype et les biais qu'elle apporte au changement évolutif, et sur la génétique de la régulation du développement survenant au cours de l'expérience du cycle de vie sur les origines de la multicellularité. En plus de cela, Dave Rogers a été le fer de lance de la reconstruction d'outils construits au siècle dernier afin qu'ils fonctionnent maintenant beaucoup plus efficacement. Il a également développé une foule de nouveaux outils pour la génétique analytique des Pseudomonas.

Évolution inverse

L'expérience d'évolution inverse mentionnée ci-dessus est un retour à des travaux antérieurs, dont une grande partie n'a pas encore été publiée. L'expérience impliquait la propagation répétée de 12 lignes répliquées dans deux environnements contrastés (microcosmes statiques et secoués). Dès qu'un nouveau mutant adaptatif apparaissait, par exemple dans le microcosme statique (non ébranlé), il était isolé et réintroduit dans un microcosme ébranlé où il rencontrait un environnement auquel il était inadapté. Une autre mutation compensatoire était donc nécessaire, qui une fois obtenue, a permis d'isoler le mutant et de le ramener dans un microcosme frais et inébranlable. Le schéma est présenté ci-dessous.


Réponse libre

Résoudre la structure génétique d'une population avec 12 individus homozygotes récessifs (Yy), 8 individus homozygotes dominants (YY) et 4 individus hétérozygotes (Yy).

p = (8*2 + 4)/48 = 0,42 q = (12*2 + 4)/48 = 0,58 p 2 = 0,17 2pq = 0,48 q 2 = 0,34

Expliquez le principe de Hardy-Weinberg de la théorie de l'équilibre.

Le principe d'équilibre de Hardy-Weinberg est utilisé pour décrire la constitution génétique d'une population. La théorie affirme que les fréquences d'allèles et de génotypes d'une population sont intrinsèquement stables : à moins qu'une sorte de force évolutive n'agisse sur la population, génération après génération, la population porterait les mêmes gènes et les individus, dans leur ensemble, auraient essentiellement la même apparence. .

Imaginez que vous essayez de tester si une population de fleurs est en train d'évoluer. Vous soupçonnez qu'il y a une pression de sélection sur la couleur de la fleur : les abeilles semblent se regrouper plus souvent autour des fleurs rouges que des fleurs bleues. Dans une expérience distincte, vous découvrez que la couleur de la fleur bleue est dominante sur la couleur de la fleur rouge. Dans un champ, vous comptez 600 fleurs bleues et 200 fleurs rouges. Quelle serait, selon vous, la structure génétique des fleurs ?

Le rouge est récessif donc q2 = 200/800 = 0,25 q = 0,5 p = 1-q = 0,5 p2 = 0,25 2pq = 0,5. Vous vous attendriez à 200 fleurs bleues homozygotes, 400 fleurs bleues hétérozygotes et 200 fleurs rouges.


Voir la vidéo: Kuidas lugeda e-raamatuid? (Mai 2022).


Commentaires:

  1. Dariel

    Bravo, ta pensée est très bonne

  2. Khalid

    Opinion très drôle

  3. Bralkis

    Oui vraiment, merci



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